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深圳市艾斯基因科技有限公司
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張老師

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深圳市光明區(qū)鳳凰街道鳳凰社區(qū)招商局光明科技園A4棟13樓

甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)

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采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測序
產(chǎn)品介紹

甲基化DNA免疫沉淀測序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq),

采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測序,

可以在全基因組水平上進(jìn)行高精度的CpG密集的高甲基化區(qū)域研究,

是分析基因組DNA甲基化變化的一種準(zhǔn)確可靠的技術(shù)。

用心服務(wù)每一個(gè)項(xiàng)目

艾斯團(tuán)隊(duì)專注表觀組學(xué)10年,提供專業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

最早開發(fā)MeDIP-seq技術(shù)團(tuán)隊(duì)之一, 嚴(yán)格的內(nèi)參質(zhì)控;

已經(jīng)完成人、小鼠、大鼠、豬等多個(gè)物種MeDIP-seq項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn);

核心團(tuán)隊(duì)在Nature communications, Genome biology等雜志發(fā)表多篇SCI論文;

專業(yè)的生物信息分析團(tuán)隊(duì), 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

科學(xué)方案設(shè)計(jì)

從項(xiàng)目方案、樣本處理、建庫測序,到數(shù)據(jù)分析;

每個(gè)項(xiàng)目需要專業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

樣本類型和要求

樣本類型/文庫類型

樣本要求

基因組DNA (TAB-WGBS)

總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

基因組DNA (TAB-RRBS)

總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等

按照送樣要求準(zhǔn)備

備注:用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸

信息分析

TAB-seq

分析內(nèi)容

備注

標(biāo)準(zhǔn)分析

1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估

過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù),保證數(shù)據(jù)質(zhì)量

2、氧化率及亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化率評估

通過內(nèi)參進(jìn)行質(zhì)控文庫

3、與參考基因組比對

比對率和覆蓋度分析

4、5hmC位點(diǎn)Calling

評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)

5、5hmC圖譜分析

5hmC在基因組、功能元件上的分布

6、組間差異DhMR分析

尋找DhMR及注釋

7、差異5hmC基因分析

DMG富集分析GO,KEGG

8、多樣本聚類分析

PCA分析多樣本5hmC變化規(guī)律

高級分析

9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析

10、其它定制化分析

結(jié)合課題背景亮點(diǎn)挖掘


甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)
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0755-28507994
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甲基化DNA免疫沉淀測序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq),

采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測序,

可以在全基因組水平上進(jìn)行高精度的CpG密集的高甲基化區(qū)域研究,

是分析基因組DNA甲基化變化的一種準(zhǔn)確可靠的技術(shù)。

用心服務(wù)每一個(gè)項(xiàng)目

艾斯團(tuán)隊(duì)專注表觀組學(xué)10年,提供專業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

最早開發(fā)MeDIP-seq技術(shù)團(tuán)隊(duì)之一, 嚴(yán)格的內(nèi)參質(zhì)控;

已經(jīng)完成人、小鼠、大鼠、豬等多個(gè)物種MeDIP-seq項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn);

核心團(tuán)隊(duì)在Nature communications, Genome biology等雜志發(fā)表多篇SCI論文;

專業(yè)的生物信息分析團(tuán)隊(duì), 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

科學(xué)方案設(shè)計(jì)

從項(xiàng)目方案、樣本處理、建庫測序,到數(shù)據(jù)分析;

每個(gè)項(xiàng)目需要專業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

樣本類型和要求

樣本類型/文庫類型

樣本要求

基因組DNA (TAB-WGBS)

總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

基因組DNA (TAB-RRBS)

總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等

按照送樣要求準(zhǔn)備

備注:用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸

信息分析

TAB-seq

分析內(nèi)容

備注

標(biāo)準(zhǔn)分析

1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估

過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù),保證數(shù)據(jù)質(zhì)量

2、氧化率及亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化率評估

通過內(nèi)參進(jìn)行質(zhì)控文庫

3、與參考基因組比對

比對率和覆蓋度分析

4、5hmC位點(diǎn)Calling

評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)

5、5hmC圖譜分析

5hmC在基因組、功能元件上的分布

6、組間差異DhMR分析

尋找DhMR及注釋

7、差異5hmC基因分析

DMG富集分析GO,KEGG

8、多樣本聚類分析

PCA分析多樣本5hmC變化規(guī)律

高級分析

9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析

10、其它定制化分析

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